CDS менен ORF ортосундагы негизги айырма - CDS - бул протеинге айланган гендин нуклеотиддердин ырааттуулугу, ал эми ORF - бул котормо башталышынан (старт кодон) башталып, ген менен аяктаган ДНК ырааттуулугунун узундугу. которууну токтотуу сайты (кодонду токтотуу).
Гендин коддоо ырааттуулугу (CDS) бар. Ал гендин жалпы экзондорунан жана баштоо кодонунан жана токтотуу кодонунан турат. Бул протеинди которгон жана өндүргөн гендин чыныгы бөлүгү. Ачык окуу алкагы же ORF – бул башталгыч кодон менен токтотуу кодонунун ортосунда жайгашкан нуклеотиддердин ырааттуулугу. ORF ичинде протеинге айланган генетикалык кодду үзгүлтүккө учураткыч кодон жок. Прокариоттордо гендин CDS жана ORF бирдей.
CDS деген эмне?
CDS же коддоо ырааттуулугу гендин белокко айланган бөлүгү. Ал экзондордон жана AUG кодону жана токтотуу кодону деп аталган эки кодондон турат. CDS эки Которулбаган аймакты камтыбайт: 5' UTR жана 3 UTR. Мындан тышкары, интрондор CDSке кирбейт.
01-сүрөт: Коддоо ырааттуулугу
Инсандын бүт геному менен салыштырганда, коддоо ырааттуулугу кичинекей бөлүкчө болуп саналат. Коддоо ырааттуулугу белоктун аминокислота ырааттуулугун түзүү үчүн зарыл болгон нуклеотиддердин ырааттуулугунан турат. Демек, CDS - бул нуклеотиддик триплеттерге же кодондорго бөлүнүшү мүмкүн болгон концентрацияланган экзондор. Кодондор аминокислоталарды пайда кылат.
ORF деген эмне?
Ачык окуу алкагы же ORF – бул нуклеотиддердин ырааттуулугунун үзгүлтүксүз узундугу, ал баштоо кодону менен башталып, токтотуу кодону менен аяктайт. Жөнөкөй сөз менен айтканда, ORF баштоо жана токтотуу кодондорунун ортосунда жайгашкан нуклеотиддердин ырааттуулугунун аймагын билдирет. Ортосунда, ORF үзгүлтүккө учураган эч кандай аялдама кодон жок. Баштоо жана токтотуу кодонунун ортосундагы нуклеотиддердин ырааттуулугу аминокислоталарды коддойт. Жалпысынан, баштоо кодону ATG, ал эми токтотуу кодондору TAG, TAA жана TGA. ORF транскрипциялоо жана которууда функционалдык белок берет. Демек, ORF башталгыч кодонду, ортоңку аймактагы бир нече кодонду жана токтотуу кодонду камтыйт. Кызыктуусу, ORF узундугу үчкө бөлүнөт.
02-сүрөт: Окуу алкагын ачуу
Прокариоттордо интрондор жок болгондуктан, ORF түз мРНКга транскрипцияланган гендин коддоо ырааттуулугу. Демек, CDS жана PRF прокариоттордо бирдей. Прокариоттордо гендерди издөөдө ORF аныктоо жана прокариоттордо генди табуу оңой. Эукариоттордо интрондор бар болгондуктан, ORF - бул кайра иштетүүдөн же РНК сплайцинациясынан кийин пайда болгон кодон тизмеги. ORF – бул генди болжолдоого жардам берген далил, анткени ORF гендин бир бөлүгү болушу мүмкүн.
CDS жана ORF ортосунда кандай окшоштуктар бар?
- Прокариоттордо CDS жана ORF бирдей.
- Экөө тең баштоо жана токтотуу кодонуна ээ.
- Аларда үчкө бөлүүгө боло турган бир катар нуклеотиддер бар.
- Алар которулгандан кийин аминокислота тизмегин чыгарышат.
CDS жана ORF ортосунда кандай айырма бар?
CDS - бул протеинге айланган гендин чыныгы бөлүгү, ал эми ORF - башталгыч кодон менен токтотуу кодонунун ортосундагы ДНКнын узундугу. Ошентип, бул CDS жана ORF ортосундагы негизги айырма. Андан тышкары, CDS интрондорду камтыбайт, бирок ORF интрондорду камтышы мүмкүн. CDS толук mRNA ырааттуулугуна толугу менен транскрипцияланат, ал эми ORF mRNA ырааттуулугунун бир бөлүгү боло алат. Ошентип, бул CDS менен ORF ортосундагы дагы бир айырма.
Төмөндө инфографика таблицасы CDS менен ORF ортосундагы айырмачылыктарды жанаша келтирет.
Кыскача – CDS жана ORF
CDS жана ORF гендин эки маанилүү бөлүгү. CDS протеинге которулган ДНКнын чыныгы аймагын билдирет. ORF – бул “ATG” старт кодонунан башталып, үч токтотуу кодондорунун (TAA, TAG же TGA) каалаганы менен аяктаган ДНКнын ырааттуулугу. ORF гендин толук мРНКсынын бир бөлүгү болушу мүмкүн. Бирок, гендин коддоо ырааттуулугу mRNA ырааттуулугун толуктоо үчүн транскрипцияланат. Бардык CDSs ORF болуп саналат. Бирок бардык ORFs CDS эмес. Ошентип, бул CDS менен ORF ортосундагы айырманы жалпылайт.
