LAMP менен ПТР тестинин негизги айырмасы - LAMP туруктуу температурада (60-650C) күчөтүү аркылуу ДНКнын көчүрмөсүн алуу үчүн, ал эми ПТР өткөрүлөт. күчөтүү аркылуу ДНКнын копияларын өндүрүү үчүн температуранын бир катар өзгөрүүлөрүн колдонуу.
LAMP жана ПТР экөө тең ДНКнын миңдеген көчүрмөлөрүн өндүрүү үчүн колдонулган in vitro күчөтүү ыкмалары. LAMPда өндүрүлгөн ДНКнын көлөмү RT-PCR сыяктуу ПТР ыкмаларында өндүрүлгөн суммадан бир топ жогору. LAMP ПТР техникасына салыштырмалуу жаңы ыкма. Бирок бул лабораториялык шарттарда такшалган илимпоз үчүн техникалык жактан жөнөкөй жана оңой. Бул аны COVID-19ду аныктоо үчүн потенциалдуу пайдалуу ыкма кылат. Бирок, RT-PCR COVID-19 үчүн учурдагы стандарттык тест болуп саналат. Бул ыкмалар, ДНКны күчөтүү боюнча билими бар изилдөөчүлөр жана клиникалар үчүн жакшы белгилүү болгон менен, кеңири коомчулукка дагы эле белгисиз болушу мүмкүн.
LAMP Test деген эмне?
COVID-19 анализдери үчүн цикл ортомчу изотермикалык күчөтүү (LAMP) тампондун жардамы менен мурундан же тамактан үлгүлөрдү чогултуу менен башталат. Үлгүлөрдү башка ыкмалар менен да чогултса болот, мисалы, катуу жөтөлдөн былжыр. RT-PCR сыяктуу ПТР ыкмасы сыяктуу, үлгүдөгү вирустук РНК алгач ДНКга айланат, бул аны көчүрүүгө мүмкүндүк берет. LAMP реакциясы туруктуу температурада (60-650C) жүргүзүлөт.
ЛАМП технологиясын жана реагенттерди камтыган вирустук ДНКнын күчөшүн реакция аралашмасы “магний пирофосфатынын” өндүрүшүнөн улам булуттуу болуп калганда аныктоого болот. Бул булуттуулук илимпоздор жана клиникалар тарабынан COVID-19 диагнозун оңой аныктоого мүмкүндүк берет. Сыноонун натыйжаларынын тактыгын атайын флуоресценттик боёкторду же реакция аралашмасында түсүн өзгөртүүчү боёкторду колдонуу менен жогорулатууга болот. Бул боёктор вирустун ДНКсы менен өз ара аракеттенишет жана жарыктын интенсивдүүлүгүнүн же түстүн өзгөрүшүнүн болжол менен үлгүдөгү вирустук РНК молекулаларынын санын берүү үчүн өлчөөгө болот.
ПЦР тести деген эмне?
ПТР – бул ДНКны аныктоо үчүн 20-30 жылдан бери изилдөөдө жана медицинада кеңири колдонулган өтө кеңири таралган илимий ыкма. ПТР тесттери вирустук РНКны аныктоо аркылуу антигенди аныктоо үчүн түздөн-түз колдонулат. Жалпысынан алганда, вирустук РНК антителолорду тапканга же оорунун белгилерин алганга чейин организмде болот. Ошондуктан, ПЦР тести кимдир бирөөнүн вирусу бар же жок экенин эрте аныктай алат. Учурда ПТР COVID-19ду аныктоо үчүн стандарттуу тест болуп саналат. ПТР ыкмаларынын ар кандай түрлөрү бар, мисалы, реалдуу убакыттагы ПТР, уяча ПТР, мультиплекстик ПТР, ысык баштоо ПТР жана узак аралыктагы ПТР ж.б. ПТР күчөтүү аркылуу ДНКнын көчүрмөлөрүн алуу үчүн температуранын бир катар өзгөрүүлөрүн колдонот.
RT-PCR – бул ПТР техникасынын өзгөчө версиясы. Бул РНК аныкталып жатканда колдонулат. Азыр ал COVID-19ну сыноо үчүн колдонулат. RT-ПТР кыйла сезгич жана ишенимдүү ыкма болуп саналат. RT-PCRде үлгү алынгандан кийин, химиялык заттар керексиз белокторду, майларды жана башка молекулаларды жок кылуу үчүн колдонулат, РНКны артта калтырышат. Сыноочу комплект ферменттери адегенде РНКны ДНКга айлантат, андан кийин вирусту аныктоо үчүн вирустун ДНКсын күчөтөт. Флуоресценттик боёктор, адатта, күчөтүлгөн ДНКга байланып, жарыкты өндүрүү үчүн колдонулат. Сыноо жыйынтыгын чыгаруу үчүн муну машина окуй алат.
LAMP жана ПТР тестинин кандай окшоштуктары бар?
- Алар күчөтүү ыкмалары.
- Экөө тең копияланган ДНКны түзүшөт.
- Алар антителолорду аныктоо сыяктуу иммундук техникага караганда өтө сезгич жана ишенимдүү ыкмалар.
- Алар экөө тең COVID-19 тести үчүн колдонулат.
LAMP жана ПТР тестинин ортосунда кандай айырма бар?
LAMP жана ПТР сыноолорунун негизги айырмасы, LAMPда күчөтүү туруктуу температуранын (60-650C) жардамы менен ишке ашат, ал эми ПТРде цикл температуралар талап кылынат. Учурда LAMP техникасынын бир нече түрлөрү бар. Бирок COVID-19ду аныктоо үчүн эң маанилүүлөрү - бул тескери транскрипция цикли аркылуу изотермикалык ыкма (RT-LAMP) жана транскрипция аркылуу күчөтүү (TMA). Андан тышкары, учурда клиникалык практикада оорунун диагностикасы үчүн ПТР ыкмаларынын ар кандай түрлөрү бар, мисалы, реалдуу убакыттагы ПТР, RT-PCR, уяча ПТР, мультиплекстик ПТР, ысык баштоо ПТР, узак аралыктагы ПТР ж.б.
Төмөнкү инфографикада LAMP менен ПТР тестинин ортосундагы айырмачылыктар таблица түрүндө келтирилген.
Кыскача маалымат – LAMP vs PCR Test
Илмек аркылуу жасалган изотермикалык күчөтүү RT-PCR сыяктуу ПТР тесттерине окшош процесс, бирок ал туруктуу температурада көбүрөөк вирустук ДНКнын копияларын чыгарат. Полимераздык чынжыр реакциясынын тести учурда COVID-19 диагнозу сыяктуу ооруларды диагностикалоо үчүн дүйнөдө эң кеңири таралган жана стандарттуу тестирлөө формасы болуп саналат. Бул кыйла ишенимдүү болуп саналат. ПТР күчөтүү аркылуу ДНКнын копияларын өндүрүү үчүн температуранын бир катар өзгөрүүлөрүн колдонот. Ошентип, бул LAMP менен ПЦР тестинин ортосундагы айырманы жалпылайт.
