Альфа жана бета спиралынын ортосундагы негизги айырма бул структураларды иштеп чыгууда пайда болгон суутек байланышынын түрүнө көз каранды. Альфа спиральдары молекулалар аралык суутек байланыштарын түзсө, бета спиралдар молекулалар аралык суутек байланыштарын түзөт.
Татаал белоктордун төрт структуралык уюштуруу деңгээли бар – баштапкы, экинчи, үчүнчү жана төртүнчү. Белоктордун экинчилик структуралары ар кандай багыттагы пептиддик чынжырларды түзөт. Пептиддик чынжырлар пептиддик байланыштар менен байланышкан аминокислота тизмегинен турат. Демек, белоктордо альфа спиралы жана бета спиралы сыяктуу эки негизги экинчи структура бар. Мындан тышкары, бета бурулуш жана чач кычкач структуралары деп аталган башка экинчи структуралар бар. Негизинен, бул макала альфа жана бета спиралынын ортосундагы айырмага багытталган.
Alpha Helix деген эмне?
Протеиндер төрт структуралык уюмга ээ. Алардын ичинен альфа спиралы белоктордун эң кеңири таралган экинчи структурасы болуп саналат. Жана, бул структура борбордук огунун айланасында жараланган таякча катары көрүнөт. Мындан тышкары, альфа спиралы оң-тараптуу спирал болуп саналат. Бирок, сол-тараптуу спиральдар да болушу мүмкүн. Бул жерде пептиддик байланыштар амино-терминалдан карбокси-терминалга чейин пайда болот. Бул пептиддик байланыштар аркылуу аминокислоталар бири-бири менен байланышат. Молекулярдык суутек байланыштары альфа спиралынын пайда болушунун негизги себеби болуп саналат.
01-сүрөт: Alpha Helix
Альфа спиралынын жайгашуусу белоктун гидрофилдик жана гидрофобдук мүнөзүнө жараша болот. Эгерде аминокислота ырааттуулугу көп сандагы гидрофилдик R (өзгөрмө) топторунан турса, R топтору суу фазасына багыт алышат. Эгерде өзгөрмө топтор гидрофобдук болсо, алар чөйрөнүн гидрофобдук фазасына чыгып кетет. Ар бир сценарийде R топтору спираль структурасынан чыгып кеткендей көрүнөт. Бул структуралык өзгөчөлүктөрүнөн улам альфа спиралы мутацияларга туруктуураак. Ошентип, суутек байланыштарынын болушу альфа спиралынын структурасын турукташтырат. Альфа спиралында бир бурулушта орто эсеп менен 3,6 калдык болот, анткени суутек байланыштарынын өнүгүшү үчүн 3,6 калдык керектелет. Коллаген жана кератин сыяктуу кээ бир структуралык белоктор альфа спиральдарына бай.
Beta Helix деген эмне?
Бета спираль белоктун экинчи таралган экинчи структурасы. Ал альфа спиралындай кеңири таралбаса да, бета спиралынын болушу да белоктун түзүлүшүндө чоң роль ойнойт. Бета спиралынын түзүлүшү параллелдүү же антипараллельдик модада жайгаштырылган эки бета барагы аркылуу ишке ашат. Бул барактар андан кийин спиралдык түзүлүшкө айланат. Эки барак жиптин ортосундагы молекулалар аралык суутек байланыштары бета спиралынын пайда болушуна жардам берет.
02-сүрөт: Бета Helix
Бета спиральдары алардын туташтыруу үлгүлөрүнө жараша оң же сол колдо болушу мүмкүн. Бета спиралын түзүүдө эки бета барактын өзгөрмө топтору спиралдын өзөгүндө жайгашат. Демек, бета баракчаларды түзгөн топтордун көпчүлүгү гидрофобдук функцияларга ээ.
Альфа спиралынан айырмаланып, 17 калдык Бета спиралында бир бурулушту түзөт. Металл иондору Бета спиралынын пайда болушун активдештирүү жөндөмүнө ээ. Альфа спиралына окшоп, суутек байланыштары Бета спиралынын түзүмүн сактоого жардам берет. Карбоангидраза ферменти жана пектат лиаза бета спиральдарына бай эки протеин болуп саналат.
Alpha жана Beta Helixтин кандай окшоштуктары бар?
- Alpha жана Beta Helix белоктордун эки экинчилик структурасы.
- Аминокислоталар эки экинчилик структуралардын мономерлери болуп саналат.
- Мындан тышкары, альфа жана бета спиральдарынын химиялык курамы көмүртек, суутек, кычкылтек, азот жана күкүрт болуп саналат.
- Ошондой эле, эки орто түзүм тең жогорку деңгээлдеги уюмга айланат.
- Андан тышкары, экөө тең суутек байланыштары менен турукташтырылган.
- Эки структурада тең гидрофобдук аминокислоталардын R топторунун болушу менен аныкталат.
Alpha жана Beta Helixтин ортосунда кандай айырма бар?
Альфа жана бета спираль ортосундагы негизги айырма алар көрсөткөн суутек байланышынын түрү болуп саналат. Альфа спиралы молекулалар аралык суутек байланышын көрсөтөт, ал эми бета спиралы молекулалар аралык суутек байланышын көрсөтөт. Мындан тышкары, альфа спиралы оң-тараптуу спиралды түзөт, ал эми бета спиралы оң жана сол-тараптуу спиралдарды түзө алат. Демек, бул дагы альфа менен бета спиралынын ортосундагы олуттуу айырма.
Мындан тышкары, альфа жана бета спиралынын дагы бир айырмасы, альфа спиралынын пайда болушу аминокислота ырааттуулугунун бурмаланышы менен ишке ашат, ал эми бета спиралынын пайда болушунда эки бета барагы параллелдүү же антипараллель менен байланышкан. спиралдык түзүлүштү түзөт.
Төмөнкү инфографикада альфа менен бета спиральынын ортосундагы айырма тууралуу көбүрөөк маалымат берилген.
Кыскача маалымат – Alpha жана Beta Helix
Альфа спиралдары да, бета спиралдары да татаал белок структураларын аныктоодо жана чыгарууда маанилүү. Эки түрү тең белоктордун экинчи структуралары. Бирок, альфа спираль аминокислота тизмегинин спираль түрүндөгү ийрилиги. Ал эми бета спиралынын пайда болушу параллелдүү же антипараллель бета барактарынын суутек байланышы аркылуу ишке ашат. Мындан тышкары, суутек байланышы альфа спиралдык формада интрамолекулярдык, ал эми суутек байланышы бета спиралдык формада молекулалар аралык болот. Мындан тышкары, бул эки структурада белоктун гидрофобдугун аныктаган R тобу бар. Ошентип, бул альфа жана бета спиралынын ортосундагы айырманы жалпылайт.
