Негизги айырма – RNASE A жана RNASE H
Рибонуклеазалар РНКны кичине бирдиктерге деградациялоочу нуклеазалар. Аларды эки категорияга бөлүүгө болот; эндорибонуклеазалар жана экзорибонуклеазалар. Эндорибонуклеаза - бул бир катарлуу же эки тилкелүү РНКны деградациялай турган эндонуклеаза. Ал РНК полинуклеотиддик чынжырындагы фосфодиэстер байланыштарын ажыратат. Мисалдар RNase A, RNase III, RNase T1, RNase P жана RNase H. Эксорибонуклеаза - бул экзонуклеаза, ал РНК молекуласынын 5'учунан же 3'учунан терминалдык нуклеотиддерди алып салуу менен РНКны начарлатат. Мисалдар RNase R, RNase II, RNase D жана RNase PH. RNASE A жана RNASE H ортосундагы негизги айырма, RNase A - бул панкреатикалык рибонуклеаза, ал бир катарлуу РНКны майда компоненттерге деградациялайт, ал эми RNase H - бул РНК-ДНК гибридиндеги РНКны майда бирдиктерге бөлүүчү спецификалык эмес фермент. гидролитикалык механизм.
RNASE A деген эмне?
РНаза А – бул панкреатикалык рибонуклеаза, ал бир катарлуу РНКнын 3' учундагы жупташкан эмес цитозин менен урацил калдыктарын атайын ажыратат. RNase H жогорку туз концентрациясында иштейт (0,3M же андан жогору NaCl концентрациясы). Гидролитикалык реакция эки баскычтан турат. Ал 2', 3' циклдик монофосфат аралыгы аркылуу 3' фосфорланган продуктуну түзөт. Ал туздун жогорку концентрациясында бир катарлуу РНКга мүнөздүү болсо да, ал ошондой эле төмөнкү NaCl концентрациясында (0,3M NaClден төмөн) РНК-ДНК гибридиндеги кош тизмектүү РНКны жана РНКны деградациялай алат.
Брюс Меррифилд биринчи жолу бул ферментти синтездеген. RNase A молекулярдык изилдөөдө абдан популярдуу энзим болуп саналат. Уйдун уйку безинин RNase A RNase A үлгүсү. Жана бул лабораторияда колдонулган эң күчтүү ферменттердин бири. Бул фермент өзүнүн активдүүлүгү үчүн кофакторго муктаж эмес. Бул абдан термосбилдүү фермент. RNase A туура аминокислота ырааттуулугу аныкталган биринчи фермент жана үчүнчү белок. Бул фермент 124 аминокислота жана 12600да молекулалык массасы менен абдан кичинекей. Жана анын төрт гистидин калдыктары бар (Анын 12 жана Анын 119 каталитикалык реакцияга катышат).
01-сүрөт: RNase A
RNase A чийки үлгүнү кайнатуу аркылуу бөлүп алса болот. Кайнаганда, калган бардык ферменттер калган RNase A бузат. RNase A укмуштуудай туруктуу фермент. Бул фермент рибонуклеаза ингибиторунун протеин, оор металл жана уридин ванадатты комплекстери менен ингибирлейт.
RNase H деген эмне?
RNase H – бул гидролитикалык реакция аркылуу РНК-ДНК гибридиндеги РНКны деградациялоочу спецификалык эмес рибонуклеаза ферменти. RNase H РНК-ДНК гибридиндеги РНКнын 3'- O-P байланышын ажыратат. Акыр-аягы, ал 3'OH жана 5' phosphate токтотулган продуктыларды чыгарат. ДНКнын репликациясында ал жаңы ДНК тилкелери пайда болгондон кийин РНК праймерин алып салуу менен негизги ролду ойнойт. Лабораториялык шарттарда, ал РНК-ДНК гибридиндеги РНКны атайын бузат, бирок ДНК менен гибриддештирилбеген РНКны эмес. Жана бул фермент көбүнчө cDNA синтези учурунда биринчи толуктоочу ДНК тизмеги пайда болгондон кийин РНК шаблонун жок кылуу үчүн колдонулат.
02-сүрөт: RNase H
RNase H да нуклеазаны коргоо анализдеринде колдонот. Аны мРНКдан поли А куйругун алып салууга да кошууга болот. RNase H клетканын ичиндеги жана сыртындагы коддолбогон РНКны жок кылуу жөндөмүнө ээ. Металл иондору бул белок активдүүлүгү үчүн кофакторлор катары талап кылынат. RNase H ферментин бөгөттөө үчүн хелатор (EDTA) колдонулушу мүмкүн.
RNASE A жана RNASE H ортосунда кандай окшоштуктар бар?
- Экөө тең табиятта белок.
- Экөө тең эндорибонуклеаза
- Экөө тең РНКны бузушу мүмкүн.
- Экөө тең гидролитикалык реакцияларды аткарышат.
- Молекулярдык лабораториялар бул экөөнү тең пайдаланат.
RNASE A жана RNASE H ортосунда кандай айырма бар?
RNASE A vs RNASE H |
|
| RNase A – бул уйку безинин рибонуклеазасы, ал өзгөчө бир катарлуу РНКнын жупташтырылбаган цитозин жана урацил калдыктарынын 3' учунун туздун жогорку концентрациясында ажыратат. | RNase H – гидролитикалык реакция аркылуу РНК-ДНК гибридиндеги РНКны деградациялай турган спецификалык эмес рибонуклеаза ферменти. |
| РНКнын ажырашынын табияты | |
| RNase A өзгөчө туздун жогорку концентрациясында бир катарлуу РНКны ажыратат. | RNase H РНК-ДНК гибридиндеги РНКны ажыратат. |
| Аракеттик факторлорго муктаждык | |
| RNase A анын активдүүлүгү үчүн кофакторлорго муктаж эмес. | RNase H анын активдүүлүгү үчүн кофактор катары металл ионуна муктаж. |
| Протеин активдүүлүгүнүн ингибиторлору | |
| Рибонуклеаза ингибиторунун протеин, оор металл жана уридин ванадатты комплекстери РНК А активдүүлүгүн бөгөттөйт. | Хелатор (EDTA) RNase H активдүүлүгүн бөгөттөйт. |
| ДНК репликациясында РНК праймерин жок кылуу | |
| RNase A ДНКнын репликациясында РНК праймерин алып салуу үчүн колдонулбайт. | RNase H ДНКнын репликациясында РНК праймерин алып салуу үчүн колдонулат |
| ДНК шаблонун толуктоочу ДНКнын (C-DNA) синтезинде алып салуу | |
| RNase A толуктоочу ДНК (C-DNA) синтези учурунда РНК үлгүсүн алып салуу үчүн колдонулбайт. | RNase H толуктоочу ДНК (C-DNA) синтези учурунда РНК үлгүсүн алып салуу үчүн колдонулат. |
| Олигого (dt) гибриддештирилген mRNAдагы поли-А-куйрукту алып салуу | |
| RNase A олигого (dt) гибриддештирилген мРНКдагы "поли-А куйругун" алып салуу үчүн колдонулбайт. | RNase H олигого (dt) гибриддештирилген мРНКдагы "поли-А куйругун" жок кылуу үчүн колдонулат |
Кыскача маалымат – RNASE A и RNASE H
Рибонуклеазалар РНКны майда бирдиктерге бөлүү жөндөмүнө ээ нуклеаза ферменттери. Алар эки түрү бар; эндорибонуклеазалар жана экзорибонуклеазалар. Эндорибонуклеаза бир же эки тилкелүү РНКны бузууга жөндөмдүү эндонуклеаза болуп саналат. Жана РНК полинуклеотиддик чынжырындагы фосфодиэстер байланышын ажыратат. RNase A жана RNase H эки эндорибонуклеаза болуп саналат. RNase A - бул уйку безинин рибонуклеазасы, ал өзгөчө туздун концентрациясынын жогору болгон бир катарлуу РНКнын 3' учундагы жупташтырылбаган цитозин жана урацил калдыктарын ажыратат. RNase H гидролитикалык реакция аркылуу РНК-ДНК гибридиндеги РНКны деградациялай турган спецификалык эмес рибонуклеаза ферменти. Бул RNase A менен RNase H ортосундагы айырма.
PDF RNASE A жана RNASE H жүктөп алыңыз
Сиз бул макаланын PDF версиясын жүктөп алып, шилтеме эскертүүсүнө ылайык оффлайн максаттарында колдоно аласыз. Сураныч, PDF версиясын бул жерден жүктөп алыңыз RNASE A жана RNASE H ортосундагы айырма
