dATP менен ddATP ортосундагы негизги айырма dATP ДНК синтезин токтото албайт, ал эми ddATP ДНК синтезин токтото албайт. Себеби ddATPде пентоза кантынын 3′ абалына туташтырылган H атому бар, ал эми dATPде 3′ позициясында OH тобу бар.
dNTPs ДНКнын курулуш блоктору. пурин же пиримидин негиздери боюнча dNTPs төрт түрү бар - dATP алардын бири. dATP азоттуу негизи аденозин болуп саналат. ddNTPs Сангер секвенирлөөдө колдонулган нуклеотиддер болуп саналат. ddNTP төрт түрү бар. ddATP – ddNTPs.
dATP деген эмне?
Деоксиаденозинтрифосфат – ДНКнын курулуш материалы болгон нуклеотид. ДНК полимераз ферменти ДНК синтези үчүн субстрат катары dATP колдонот. dATP үч компоненттен турат: дезоксирибоза кант молекуласы, аденозин жана үч фосфат тобу. Демек, бул пуриндик нуклеозид трифосфат. dATP химиялык формуласы C10H16N5O12 P3, жана анын молекулалык массасы 491,182.
01-сүрөт: dATP
dATP кант компоненттери боюнча АТФтен (аденозинтрифосфаттан) айырмаланат. ATP рибоза канты бар. Транскрипция учурунда урацил нуклеотиди менен dATP база жупташат. ДНК синтезине катышуудан тышкары, dATP клетканын жашоо жөндөмдүүлүгүн сактап калуу үчүн энергияны өткөрүп берүүчү молекула катары иштей алат. Организмдеги dATPдин жогорку деңгээли уулуу болуп саналат, анткени ал рибонуклеотид-редуктаза ферменти үчүн атаандаштыкка туруштук бербеген ингибитор катары иштей алат. Бул иммундук функциянын начарлашына алып келиши мүмкүн.
ddATP деген эмне?
Дидеоксиаденозин трифофафат же ddATP - Сэнгер секвенирлөө методунда колдонулган нуклеотиддердин төрт түрүнүн бири. Структуралык жактан алганда, ddATP да dATPге окшош үч компонентке ээ. Алар адениндик негиз, дезоксирибоза кант жана үч фосфат.
02-сүрөт: ddATP
dATPдан айырмаланып, ddATP чектеш нуклеотид менен фосфодиэфирдик байланышты түзүү жана чынжырдын узартылышын улантуу үчүн пентоза канттын 3ʹ абалында OH тобу жок. Анын 3' абалында Н атому бар. Ошондуктан, ddATP киргизилгенден кийин, ДНК синтези аяктайт. Бул Сэнгер секвенирлөөнүн негизги принциби. Ошондуктан, ddATP Сангер секвенирлөөсүндө чынжырдын узартылышынын ингибитору катары иштейт. Sanger секвенирлөөсүндө төрт түтүк колдонулат жана бир түтүккө ddATP кошулат.
dATP жана ddATP ортосунда кандай окшоштуктар бар?
- dATP жана ddATP - нуклеотиддер.
- Экөө тең аденин, дезоксирибоза жана үч фосфаттан турат.
- Алар органикалык кошулмалар.
- dATP жана ddATP экөө тең Сангер секвенирлөөсүндө түтүктөргө кошулат.
dATP менен ddATP ортосунда кандай айырма бар?
dATP пентоза кантынын 3' абалында OH тобуна ээ, ал эми ddATPде пентоз кантынын 3' абалында OH тобу жок. Андан тышкары, dATP - бул ДНК синтезинде колдонулган мономер, ал эми ddATP Сангер секвенирлөө учурунда чынжырдын узартылышын токтотуу үчүн колдонулат. Ошентип, бул dATP жана ddATP ортосундагы негизги айырма. Мындан тышкары, dATP фосфодиэфир байланыштарын түзө алат, ал эми ddATP фосфодиэстер байланыштарын түзө албайт.
Төмөндөгү инфографикада dATP менен ddATP ортосундагы көбүрөөк айырмачылыктар жанаша салыштыруу үчүн таблица түрүндө көрсөтүлгөн.
Корытынды – dATP менен ddATP
Кыскача айтканда, dATP ДНК синтезинин прекурсору, ал эми ddATP - Сэнгер секвенирлөөсүндө ДНК синтезин токтотуу үчүн колдонулган нуклеотид. Мындан тышкары, dATP пентоза кантынын 3' абалында OH тобуна ээ жана кийинки нуклеотид менен фосфодиэстер байланышын түзүүгө мүмкүндүк берет. Ошол эле учурда, ddATP 3' абалында OH тобу жок; демек, кийинки нуклеотид менен фосфодиэфир байланышын түзө албайт. Натыйжада, ДНК ырааттуулугу узартылышын токтотот. Ошентип, бул dATP менен ddATP ортосундагы айырманы жыйынтыктайт.
