Изошизомерлер менен неосизомерлердин ортосундагы негизги айырма - изошизомерлер бирдей таануу ырааттуулугуна ээ болгон жана ДНКны бирдей позицияларда ажыратуучу чектөө ферменттери, ал эми неосизомерлер - бирдей таануу ырааттуулугуна ээ, бирок ДНКны ар кандай позицияларда ажыратуучу чектөө ферменттери..
Чектөөчү ферменттер же чектөө эндонуклеазалары – белгилүү бир таануу жерлеринде же анын жанында ДНКны фрагменттерге бөлүүчү ферменттер. Алар чектөө сайттарында ДНКны кесип. Чектөөчү ферменттер түзүлүшү боюнча, ДНКнын субстраттарын тааныган жеринде кесип же жок кылуу, таануу жана ажыратуу жерлеринин бири-биринен өзүнчө болушу боюнча беш топко бөлүнөт.3600дөн ашык чектөө эндонуклеазалары буга чейин аныкталган. Болжол менен 800 чектөө ферменттери коммерциялык жактан жеткиликтүү. Изошизомерлер жана неосизомерлер таануу аймагына жана бөлүнүү өзгөчөлүгүнө негизделген чектөө ферменттеринин эки түрү.
Изошизомерлер деген эмне?
Изошизомерлер – бирдей таануу ырааттуулугуна ээ болгон жана ДНКны бирдей позицияларда ажыратуучу чектөө ферменттери. Бул чектөө ферменттери бирдей өзгөчөлүккө ээ. Берилген ырааттуулукту тааныган биринчи ачылган чектөө ферменти прототип деп аталат, ал эми ошол эле тизмекти тааныган бардык кийинчерээк аныкталган чектөө ферменттери изошизомерлер деп аталат. Бирок, изошизомерлер сайттын артыкчылыктары, реакция шарттары, метилденүү сезгичтиги жана жылдыз активдүүлүгү боюнча айырмаланышы мүмкүн. Изошизомерлер бактериялардын ар кандай штаммдарынан бөлүнүп алынат. Ошондуктан, алар ар кандай реакция шарттарын талап кылышы мүмкүн. Кээ бир учурларда, изошизомерлердин бир жуптун ичинен бирөө гана чектөө сайттарынын метилденген жана метилденбеген түрлөрүн тааный алат. Башка жагынан алганда, башка чектөө ферменти чектөө сайтынын unmethylated түрүн гана тааный алат. Изошизомерлердин бул өзгөчөлүгү чектөө аймагынын метилденүү абалын аныктоого жана аны бактериялык абалдан бөлүп алууга жардам берет.
Мисалы, AgeI жана BshT1 5’-A↓CCGGTди бирдей калыпта тааныйт жана ажыратат. HpaII жана MSPI изошизомерлердин башка жуптары. Экөө тең 5'-C↓CGG-3' ырааттуулугун ал метилденбегенде тааныйт. Бирок ырааттуулуктун экинчи С метилденгенде, бул ырааттуулукту MSPI гана тааный алат, ал эми HpaII аны тааный албайт.
Неошизомер деген эмне?
Неошизомерлер – бирдей таануу ырааттуулугуна ээ, бирок ДНКны ар кандай позицияларда ажыраткан чектөө ферменттери. Кээ бир өзгөчө молекулярдык биологиялык колдонмолордо бул абдан пайдалуу өзгөчөлүк. Неошизомерлер изошизомерлердин бир бөлүгү. Неошизомерлер үчүн белгилүү мисалдар SmaI (5'-CCC↓GGG-3') жана XmaI (5'-C↓CCGGG-3'); экөө тең 5'-CCCGGG-3' ырааттуулугун тааныйт, бирок аларды башка абалда ажыратышат. Ошентип, бул эки чектөө энзимдери учтардын ар кандай түрлөрүн жаратат. Бул учурда SmaI туюк учтарды, ал эми XmaI 5' чыгып турган учтарды чыгарат.
01-сүрөт: Неосхизомерлер
Дагы бир мисал - MaeII жана Tail чектөө ферменттери. MaeII прототиби (A↓CGT) 2-базалуу 5'кеңейтилген ДНК фрагменттерин, ал эми неошизомер куйругу (ACGT↓) 4-базалык3' узартуу менен ДНК фрагменттерин чыгарат.
Изошизомерлердин жана неосхизомерлердин кандай окшоштуктары бар?
- Изошизомерлер жана неосизомерлер - чектөө ферменттеринин эки түрү.
- Алар негизинен прокариоттордо кездешет.
- Алар бактериялар менен археяларда табылган чектөө-модификациялоо (RM) системасынын бир бөлүгү.
- Экөө тең белок молекулалары.
- Экөө тең ДНКны фрагменттерге бөлөт.
Изошизомерлердин жана неосизомерлердин ортосунда кандай айырма бар?
Изошизомерлер – бирдей таануу ырааттуулугуна ээ болгон жана ДНКны бирдей позицияларда ажыратуучу чектөө ферменттери, ал эми неосизомерлер – бирдей таануу ырааттуулугуна ээ, бирок ДНКны ар кандай позицияларда ажыраткан чектөө ферменттери. Ошентип, бул isoschizomers жана neoschizomers ортосундагы негизги айырма. Андан тышкары, изошизомерлер бирдей өзгөчөлүктөргө ээ, ал эми неосизомерлер ар кандай өзгөчөлүктөргө ээ.
Төмөнкү инфографикада изошизомерлер менен неосизомерлердин ортосундагы айырмачылыктар жанаша салыштыруу үчүн таблица түрүндө келтирилген.
Кыскача маалымат – Изошизомерлерге каршы Неосхизомерлерге
Чектөө ферменттери ДНКны кесүүчү ферменттер. Алар ошондой эле молекулярдык кайчы деп аталат. Чектөө ферменттеринин ар кандай түрлөрү бар. Таануу сайтына жана бөлүнүү өзгөчөлүгүнө жараша, чектөө ферменттери изошизомер жана неошизомерлер сыяктуу эки түргө бөлүнөт. Изошизомерлер бирдей таануу ырааттуулугуна ээ жана ДНКны бирдей позицияларда бөлүшөт, ал эми неосизомерлер бирдей таануу ырааттуулугуна ээ, бирок ДНКны ар кандай позицияларда ажыратышат. Ошентип, бул изошизомерлер менен неошизомерлердин ортосундагы негизги айырма.
