Изошизомерлер менен изокаудомерлердин негизги айырмасы - изошизомерлер бир эле чектөө же таануу жерин таанып, ажыратат, ал эми изокаудомерлер бир аз башкача чектөө жерлерин таанып, ошол эле жерде бөлүнөт.
Чектөөчү ферменттер же чектөө эндонуклеазалары – эки спиралдуу ДНКны ажыратуучу нуклеазалардын бир түрү. Алар келип чыгышы боюнча палиндромдук болгон чектөө жерлери деп аталган белгилүү ырааттуулуктарды тааный алышат. Бактериялар чет элдик патогендерге, өзгөчө вирустарга каршы чектөө ферменттерин чыгарышат. Бул бактериялар көрсөткөн коргонуу механизминин бир түрү. Ферменттин түзүлүшүнө жана кесүүлөрдүн табиятына жараша рестрикция ферменттеринин I түрдөгү рестрикция ферменттери, II типтеги чектөө ферменттери жана II типтеги чектөө ферменттери болуп үч түрү бар. Мындан тышкары, биохимиялык активдүүлүккө жана изоляция булагына жараша изошизомерлер, неосизомерлер жана изокаудомерлер сыяктуу үч түрдөгү чектөө ферменттери бар.
Изошизомерлер деген эмне?
Изосхизомерлер – ар кандай булактардан келген, бирок ДНКдагы бир эле чектөө аймагын таанып, ажыратуучу чектөө ферменттеринин бир түрү. Демек, эки изошизомердин таануу аймагы бирдей. Алар бир эле жерде жабышат, ошондуктан алар бирдей таануу ырааттуулугуна мүнөздүү. Мисалы, SphI жана BbuI чектөө ферменттери CGTAC/Gде таанып, ажыраган эки изошизомер.
01-сүрөт: чектөө ферменти
Изошизомерлердин дагы бир жубу HpaII жана MspI. Экөө тең 5′-CCGG-3' ырааттуулугун таанып, ДНКны ажыратат. Мындан тышкары, Bsp EI жана Acc III да тиешелүүлүгүнө жараша Bacillus жана Acinetobacter calcoaceticus түрлөрүнөн чыккан изошизомерлер. Изошизомерлерди изоляциялоо ар кандай бактериялардан жасалышы мүмкүн. Алар ар кандай бактериялардан чыккандыктан, чектөө шарттары бири-биринен айырмаланышы мүмкүн.
Изокаудомерлер деген эмне?
Изокаудомерлер бир аз башкача ырааттуулуктарды тааныган чектөө ферменттеринин бир түрү, бирок алар бирдей учтарды пайда кылуу үчүн бир жерде жарылып кетишет. Isocaudomers да ар кандай бактериялардан келет. Sau3a жана BamHI бир жуп изокаудомер болуп саналат. Алар 5'-GATC-3' жабышчаак учту ошол эле жерди ажыраткандан кийин чыгарышат. Дагы бир жуп изокаудомер Nocardia corallinaдан NcoI жана Pseudomonas alcaligenesтен PagI. Бул эки фермент да ар кандай таануу ырааттуулугунда байланышат, бирок бир жерде кесилип, бирдей жабышчаак учтарды чыгарышат. Ошондуктан, кесүүчү учтарды өндүрүү бири-бирине шайкеш келет жана алар бири-бирине байланышы мүмкүн. XhoI, PspXI жана SalI да изокаудомер болуп саналат.
Изосхизомерлердин жана изокаудомерлердин кандай окшоштуктары бар?
- Изошизомерлер жана изокадомерлер - чектөө ферменттеринин эки түрү.
- Эки изошизомердин сиңирүү жери бирдей, сиңирүү жери бирдей болгон эки изокадомерге окшош.
- Алар прокариоттук.
- Экөөнүн тең чектөөнү таануу жана тамак сиңирүү сайты бар.
- Алар бири-бирине дал келген учтарды чыгарышат.
- Мындан тышкары, бул ферменттер рекомбинантты ДНК технологиясында пайдалуу куралдар.
Изошизомерлердин жана изокаудомерлердин ортосунда кандай айырма бар?
Изосхизомерлер – бир эле ДНК ырааттуулугун таанып, ошол эле чектөө жеринде ажыраган чектөө ферменттери, ал эми изокадомерлер – бир аз башкача ДНК тизмегин тааныган, бирок ошол эле жерде кесүү менен бирдей жабышчаак учтарды чыгарган чектөө ферменттери. Демек, бул изошизомерлер менен изокаудомерлердин ортосундагы негизги айырма.
Төмөнкү инфографикада изошизомерлер менен изокадомерлердин айырмасы келтирилген.
Кыскача – Изошизомерлерге каршы Isocaudomers
Изосхизомерлер – бир эле ДНК ырааттуулугун тааныган жана ошол эле жерде ажыраган чектөө ферменттери. Башка жагынан алганда, изокаудомерлер бир аз башкача ырааттуулуктарды тааныган жана ошол эле учтарды чыгарган бир жерде жаралган чектөө ферменттери. Ошентип, бул isoschizomers жана isocaudomers ортосундагы негизги айырма. SphI, BbuI, HpaII жана MspI изошизомерлердин бир нече мисалы, ал эми Sau3a жана BamHI изокаудомерлердин эки мисалы. Изошизомерлер да, изокадомерлер да табигый түрдө бактериялар тарабынан өндүрүлөт.
