Гуанидин тиоцианаты менен гуанидин гидрохлоридинин ортосундагы негизги айырма, гуанидин тиоцианаты РНКны изоляциялоодо көбүрөөк колдонулган күчтүү белок денатурант, ал эми гуанидин гидрохлориди алсызыраак белок денатурант болуп саналат, ал РНКда азыраак колдонулат..
Денатурация - бул белоктордун төртүнчү, үчүнчү жана экинчилик структурасын жоготуу процесси. Бул күчтүү кислота же негиз, концентрацияланган органикалык эмес туз, органикалык эриткич (спирт, хлороформ), толкундануу, нурлануу же жылуулук сыяктуу кээ бир тышкы стрессти же кошулмаларды колдонуу менен жасалышы мүмкүн. Гуанидин тиоцианат жана гуанидин гидрохлориди белок денатуранттарынын эки башка түрү.
Гуанидин тиоцианат деген эмне?
Гуанидин тиоцианаты (GTC) РНКны изоляциялоодо көбүрөөк колдонулган күчтүү белокту денатурациялоочу агент. Ал ошондой эле guanidinium isothiocyanate (GITC) катары белгилүү. бир хаотроптук агент болуп, ал дайыма жалпы белок денатурант катары колдонулган химиялык кошулма болуп саналат. А хаотроптук агент суу молекулалары ортосундагы суутек байланыш тармагын бузууга мүмкүн суу эритмеси бир молекула болуп саналат. Бул гидрофобдук эффектти алсыратып, протеиндер жана нуклеин кислоталары сыяктуу макромолекулалар сыяктуу эритмедеги башка молекулалардын эне абалынын туруктуулугуна таасирин тийгизет. Гуанидин тиоцианаты сыяктуу хаотроптук агенттер гидрофобдук аминокислоталардын тегерегиндеги көлөмдөгү жана гидратациялык кабыкчаларда суу молекулалары түзгөн белоктун түзүлүшүндөгү тартиптин көлөмүн азайтат. Бул белоктун денатурациясына алып келиши мүмкүн.
Гуанидин тиоцианатын 1918-жылы испан тумоосу сыяктуу ооруларды пайда кылган грипп сыяктуу вирустарды деактивациялоо үчүн колдонсо болот. Ошондуктан, аны медициналык же оорукана орнотууларда колдонсо болот. Мындан тышкары, Гуанидин тиоцианаты РНК жана ДНК экстракцияларында клеткаларды жана вирус бөлүкчөлөрүн лизис үчүн колдонулат. Бул жерде, гуанидин тиоцианаттын милдети лизиске жардам берүү жана RNase ферменттеринин жана DNase ферменттеринин денатурациялоо аркылуу активдүүлүгүн алдын алуу болуп саналат. Бул ферменттер экстракты (РНК же ДНК) бузушу мүмкүн.
Гуанидин гидрохлориди деген эмне?
Гуанидин гидрохлориди (GdnHCl) РНКны изоляциялоодо азыраак колдонулган алсызыраак белок денатурант. Ал ошондой эле guanidinium хлориди (GdmCl) катары белгилүү. Бул гуанидиндин гидрохлорид тузу. Гуанидин гидрохлориди хаотроптук жана белоктун бүктөлүшүн физикалык-химиялык изилдөөдө колдонулган денатуранттардын бири.
Сүрөт 01: Гуанидин гидрохлориди
Гуанидин гидрохлориди ошондой эле ферменттердин активдүүлүгүн төмөндөтүү жана гидрофобдук молекулалардын эригичтигин жогорулатуу жөндөмүнө ээ. Адатта, гуанидин гидрохлоридинин жогорку концентрациясында белоктор тартиптүү түзүлүшүн жоготот. Протеиндер гуанидин гидрохлоридинин бул концентрациясында туш келди ийрилет. Медициналык же ооруканада гуанидин гидрохлориди Итон-Ламберт синдрому менен байланышкан булчуңдардын алсыздыгынын жана жеңил чарчоонун белгилерин азайтуу үчүн көрсөтүлгөн. Андан тышкары, гуанидин гидрохлоридинин терс таасирлери перистальтика, диарея жана сөөк чучугунун өлүмгө алып келиши мүмкүн.
Гуанидин тиоцианаты менен гуанидин гидрохлоридинин кандай окшоштуктары бар?
- Гуанидин тиоцианат жана гуанидин гидрохлориди белок денатуранттарынын эки башка түрү.
- Эки денатуранттын түзүмүндө гуанидин бар.
- Алар хаотроптук агенттер.
- РНКны изоляциялоо үчүн эки денатурант тең колдонулушу мүмкүн.
- Алар экөө тең медициналык же ооруканада колдонулат.
Гуанидин тиоцианаты менен гуанидин гидрохлориддин ортосунда кандай айырма бар?
Гуанидин тиоцианаты РНКны изоляциялоодо көбүрөөк колдонулган күчтүү белок денатурант агенти, ал эми гуанидин гидрохлориди РНКны изоляциялоодо азыраак колдонулган алсызыраак белок денатурант. Ошентип, бул гуанидин тиоцианат менен гуанидин гидрохлоридинин ортосундагы негизги айырма. Мындан тышкары, гуанидин тиоцианаттын химиялык формуласы C2H6N4S, ал эми химиялык формула гуанидин гидрохлориддин CH5N3HCl.
Төмөнкү инфографикада гуанидин тиоцианаты менен гуанидин гидрохлоридинин ортосундагы айырмачылыктар жанаша салыштыруу үчүн таблица түрүндө берилген.
Кыскача маалымат – Гуанидинтиоцианат менен Гуанидингидрохлорид
Гуанидин тиоцианаты жана гуанидин гидрохлориди белок денатуранттарынын эки башка түрү. Эки денатурант тең хаотроптук заттар. Гуанидин тиоцианаты РНК изоляциясында көбүрөөк колдонулган күчтүү белок денатурант агенти, ал эми гуанидин гидрохлориди РНКны изоляциялоодо азыраак колдонулган алсызыраак белок денатурант болуп саналат. Ошентип, бул гуанидин тиоцианат менен гуанидин гидрохлориддин ортосундагы айырманы жалпылайт.
