Генетикалык карта менен физикалык картанын ортосундагы негизги айырма геномдун картасын түзүүдө колдонулган ыкмаларда. Генетикалык картаны түзүүдө генетикалык маркерлер жана генетикалык локустар гендердин байланыш схемаларын изилдөө үчүн колдонулат, ал эми физикалык картада чектөө фрагментинин узундугу полиморфизми (RFLP) жана гибриддештирүү ыкмалары сыяктуу молекулярдык биология ыкмалары колдонулат.
Генетикалык карталар жана Физикалык карталар хромосомаларда жайгашкан гендерди көрсөтүү үчүн түзүлгөн карталардын эки түрү. Алар генетикалык диагностикага жана геномдук анализге байланыштуу эволюцияны болжолдоого катышат. Мындан тышкары, алар ген локустарынын ортосундагы аралыктарды талдоо жана ген полиморфизмдерин талдоо үчүн колдонушат.
Генетикалык карта деген эмне?
Генетикалык карта гендердин жайгашкан жерлерине жана байланыш анализи жана ген ассоциациясын изилдөө аркылуу аныкталган генетикалык маркерлерге негизделген. Менделдик генетика генетикалык карталарды түшүндүрөт жана Грегор Мендель бул түшүнүктү киргизген адам. Генетикалык карта хромосомалардын жайгашкан жерлерин жана өзгөчө белгилердин пайда болушуна катышкан гендерди изилдөө үчүн пайдалуу. Кыз муундар тарабынан тукум кууп өткөн бул гендер белгилүү бир оорунун же мүнөздүн генетикалык маркерлери катары аныкталат.
01-сүрөт: Генетикалык карта
Генетикалык картаны түзүүдөн мурун, көп муундар боюнча бир нече асылдандыруу ыкмалары жана андан кийин белгилүү бир өзгөчөлүк же өзгөчөлүк үчүн асыл тукум моделдерин талдоо зарыл. Ошондой эле, ген бирикмеси изилдөөлөр генетикалык картада белгилүү бир тукум куучулук моделдер үчүн жооптуу болгон ар кандай аллельдерди аныктоону колдойт. Аллель жыштыктары жана ген жыштыктары хромосомадагы белгилүү бир гендин ген картасын болжолдоого жардам берет.
Физикалык карта деген эмне?
Гендердин физикалык карталары молекулярдык биологиялык ыкмаларды колдонуу менен түзүлөт, мисалы, чектөө ферменттерин сиңирүү ж.б. Демек, чектөө картасы бул картанын башка аталышы. Физикалык картаны түзүүдө, башында чектөө ферменттери ДНКны фрагменттерге бөлүшкөн. Андан кийин бул фрагменттер гел электрофорези менен бөлүнөт. Кийинки кадам ДНКнын физикалык картасын түзүү болуп саналат. Кийинки кадам катары, алар гибриддештирүүдөн кийин тазалоо ыкмаларына дуушар болушу мүмкүн. Учурда генетикалык маркерлер катары колдонуу үчүн физикалык карталарды түзүүдө Fluorescence In situ гибриддештирүү сыяктуу жогорку өткөрүмдүүлүк ыкмалары колдонулууда.
02-сүрөт: Физикалык карта
Физикалык карталар генетикалык карталарга салыштырмалуу так жана тезирээк. Демек, гендик полиморфизмди талдоодо аларды колдонуу генетикалык карталарга салыштырмалуу жогору. Физикалык карта түзүү Менделдик генетикалык схемаларды да эске албайт.
Генетикалык карта менен физикалык картанын кандай окшоштуктары бар?
- Эки карта тең генетикалык маркерлерди мүнөздөйт.
- Геном боюнча изилдөөлөр эки картаны тең пайдаланат.
- Генетикалык карта жана физикалык карта генетикалык диагностикада пайдалуу.
Генетикалык карта менен физикалык картанын ортосунда кандай айырма бар?
Генетикалык карта – бул гендердин байланышы жана гендердин ассоциациясын изилдөөгө негизделген гендик карта, хромосоманын генетикалык маркеринде же ген локустарында. Физикалык карта – бул гендик карта, анда ген картасы физикалык жактан ДНКны бөлүп алуу жана молекулярдык биологиянын ыкмаларын колдонуу менен так генетикалык маркерди алуу жолу менен алынган. Бул эки картада колдонулган ыкмаларга келсек, генетикалык карта менен физикалык картанын ортосундагы айырма генетикалык карта гендик байланышты жана ген ассоциациясын талдоо ыкмаларын колдонот, ал эми физикалык карта чектөө картасын жана гибриддештирүү ыкмаларын колдонот. Демек, генетикалык картанын тактыгы төмөн, ал эми физикалык картада жогору.
Бул эки картада колдонулган ыкмалардын ылдамдыгын салыштырганда, генетикалык картанын ылдамдыгы азыраак, убакытты талап кылган ыкмалар бар. Бирок, физикалык карта абдан тез ыкмалары бар. Демек, физикалык карта жогорку натыйжалуу, ал эми генетикалык карта азыраак натыйжалуу. Андан тышкары, генетикалык карталар Менделдик тукум куучулук схемаларына негизделет, ал эми физикалык карталар түздөн-түз Менделдик тукум куучулук схемаларына негизделбейт.
Кыскача маалымат – Генетикалык карта менен Физикалык карта
Геномдук изилдөөлөр хромосомаларда жайгашкан генетикалык маркерлерди колдонот. Бул маркерлерди изилдөө үчүн, алар ар кандай ыкмаларды колдонуу менен картага түшүрүлүшү керек. Менделдик генетика генетикалык карталардын негизин түзөт. Генетикалык карта түзүү учурунда көптөгөн муундар үчүн ар кандай белгилер изилденип, гендердин байланышы жана ген ассоциациясы изилдөөлөрү аркылуу гендер талданат. Ал эми, физикалык ген карталары генетикалык маркерлерди бөлүп алуу жана аны бөлүп алуу менен физикалык мүнөздөмөлөрдү камтыйт. Бул генетикалык карта менен физикалык картанын негизги айырмасы.
