I класс менен II класстын транспозоляциялануучу элементтеринин негизги айырмасы I класстын транспозондук элементтери ретротранспозондор, ал эми II класстагы транспозондук элементтер ДНК транспозондору.
Транспозалануучу элемент – геномдун ичиндеги абалын өзгөртө алган ДНК ырааттуулугу. Кээде мутацияларды жаратып, тескери кылат. Ал ошондой эле клетканын генетикалык инсандыгын жана геномунун өлчөмүн өзгөртө алат. Бул процесс көбүнчө бир эле генетикалык материалдын кайталанышына алып келет. Транспозициялык элементти биринчи жолу Барбара МакКлинток ачкан жана ал 1983-жылы ачылышы үчүн Нобель сыйлыгын алган. Транспозициялык элементтерди транспозициялоо механизминин негизинде эки класска бөлүүгө болот: класс I жана II класстагы транспозициялык элементтер.
I класстын которулуучу элементтери деген эмне?
I класстын транспозоляциялык элементтери ретротранспозондор болуп саналат. Ретротранспозон - бул тескери транскрипция деп аталган процесс аркылуу РНКны кайра ДНКга айландыруу аркылуу өзүн ар кандай геномдук жерлерге көчүрүүчү жана чаптаган генетикалык компоненттин бир түрү. Бул процесс тескери транскриптаза ферменти тарабынан катализделет. Ретротранспозон адатта РНКнын транспозициясынын ортоңку бөлүгүн колдонот. Класстын I көчүрүүчү элементтери көбүнчө эки этапта көчүрүлөт. Биринчиден, алар ДНКдан РНКга транскрипцияланат. Андан кийин өндүрүлгөн РНК кайра ДНКга транскрипцияланат. Кийинчерээк бул копияланган ДНК кайра геномго жаңы абалда киргизилет. ретротранспозондордун мүнөздөмөлөрү ВИЧ сыяктуу ретровируска абдан окшош.
01-сүрөт: I класстын которулуучу элементи
Ретротранспозондор үч түргө бөлүнөт.
- Тескери транскриптазаны коддогон узун терминалдык кайталоосу бар ретротранспозондор (LTRs),
- Тескери транскриптаза үчүн коддолгон, бирок LTRсиз жана РНК полимераза II тарабынан транскрипцияланган узун кесилишкен ядролук элементтери (LINE) бар ретротранспозондор,
- Кыска кесилишкен ядролук элементтери (SINEs) бар ретротранспозондор, алар тескери транскриптаза үчүн коддалбайт жана РНК полимераза III аркылуу транскрипцияланат.
Андан тышкары, ретротранспозондор менен окшош механизмдин аркасында ретровирус да транспозоляцияланган элементтер катары каралышы мүмкүн.
II класстын которулуучу элементтери деген эмне?
Класс II транспозондук элементтер ДНК транспозондору. II класстагы транспозациялануучу элементтер РНКнын ортоңку бөлүгүн камтыбаган кесип жана паста транспозиция механизмине ээ. Транспозиция бир нече транспозаза ферменттери тарабынан катализделет. Бул ферменттер ДНКга спецификалык же спецификалык эмес түрдө байланыша алат. Транспозаза жабышчаак учтарды пайда кылган ДНКнын максаттуу жеринде тепкичтүү кесип кылат. Андан кийин алар башка максаттуу сайттарга ДНК транспозон лигаларын кесип салышат.
02-сүрөт: II класстагы которулуучу элементтер
Адатта, ДНК полимеразы жабышчаак учтардагы боштуктарды толтурат, ал эми ДНК лигаза кант-фосфат омурткасын жабат. Мындан тышкары, бул транспозиция максаттуу сайттын кайталанышына алып келет. ДНК транспозондорунун кириш жерлерин кыска, түз кайталоо, андан кийин тескери кайталоо аркылуу аныктоого болот. Бирок бардык ДНК транспозондору кесип жана паста транспозиция механизмин көрсөтө бербейт. Мисалы, кээ бир транспозондор репликативдик транспозицияны көрсөтөт, мында транспозондор жаңы максаттуу жерге көчүрүлөт.
I класс менен II класстын которулуучу элементтеринин окшоштуктары
- I класстын жана II класстын транспозоляцияланган элементтери – мобилдик генетикалык элементтер же секирүү гендер.
- Экөө тең геномдогу абалын өзгөртө алат.
- Алар ДНК ырааттуулугунан турат.
- Алар өзүмчүл генетикалык элементтер.
- Алар геномдук функцияда жана эволюцияда абдан маанилүү.
I класс менен II класстын которулуучу элементтеринин ортосундагы айырма
I класстагы транспозондук элементтер ретротранспозондор, ал эми II класстагы транспозондук элементтер ДНК транспозондору. Ошентип, бул I класс менен II класстын транспосациялануучу элементтеринин ортосундагы негизги айырма. Мындан тышкары, I класстагы транспозициондук элементтер транспозиция механизминде РНКнын ортоңку заттарды колдонушат. Экинчи жагынан, II класстагы транспозоляциялык элементтер транспозиция механизминде ДНКнын ортоңку заттарын колдонушат.
Төмөнкү инфографика класстын I жана II классынын транспозировкаланган элементтеринин ортосундагы айырмаларды жанаша салыштыруу үчүн таблица түрүндө түзөт.
Кыскача маалымат – I класска каршы II класска которулуучу элементтер
Которуучу элементтер мобилдик генетикалык элементтер же секирүүчү гендер катары белгилүү. Алар ДНК тизмеги. Транспозициялык элементтер эки класска бөлүнөт. I класстагы транспозондук элементтер ретротранспозондор, ал эми II класстагы транспозондук элементтер ДНК транспозондору. Ошентип, бул I класс менен II класстын которулуучу элементтеринин ортосундагы негизги айырма.
